サブウーファーにスピーカーケーブルで接続する場合、接続するアンプ側のダンピングファクターは影響するのでしょうか？

サブウーファーの場合、アンプのダンピングファクターの影響はほとんどありません。（アンプのダンピングファクターが影響するのはスピーカーに対してとなります）